Botanikos institutas įkurtas 1959 m. liepos 1 d., reorganizavus nuo 1945 m. rugsėjo 15 d. veikusį Lietuvos mokslų akademijos Biologijos institutą, kurį sudarė Sistematinės-eksperimentinės botanikos ir Sistematinės-eksperimentinės zoologijos poskyriai. Nuo 1992 m. Botanikos institutas – valstybinis mokslo institutas. 2009 m. gruodžio 23 d. LR Vyriausybės nutarimu Nr. 1800 Botanikos institutas, Geologijos ir geografijos institutas ir Ekologijos institutas sujungimo būdu reorganizuoti į valstybinį mokslinių tyrimų institutą Gamtos tyrimų centrą.

Botanikos institute atliekami fundamentiniai ir taikomieji botanikos, mikologijos ir mikrobiologijos tyrimai bei rengiami mokslininkai.

Svarbiausios mokslinės veiklos kryptys:

– aplinkos kokybės būklės, gamtinių ekosistemų, buveinių, rūšių, bendrijų, populiacijų struktūros, funkcionavimo, jautrumo, pažeidžiamumo, genetinės įvairovės, adaptacijų, mikroevoliucijos globalios kaitos ir antropogeninio poveikio sąlygomis dėsningumų ir mechanizmų tyrimai, teorinių pagrindų kūrimas ir prognozė;
– Lietuvos gamtos ir biologijos išteklių būklės, kaitos tyrimai ir prognozė, išsaugojimo, atkūrimo ir tvaraus naudojimo mokslinis pagrindimas.

Instituto vadovė – dr. Danguolė Raklevičienė, tel. (8 5)2711618, (8 5)2729633, el. p. danguole.rakleviciene@botanika.lt

Mokslinė sekretorė – dr. Aurika Ričkienė, tel. (8 5)2697740, (8 5)2729839, el. p. aurika.rickiene@botanika.lt