Vadovas – vyr. m. d., habil. dr., Juozas Staniulis
Vyresn. m. d., dr. Rasa Jomantienė
M. d., dr. Marija Samuitienė
M. d., dr. Irena Zitikaitė
M. d., dr. Laima Urbanavičienė
M. d., dr. Deividas Valiūnas
Doktorantė Marija Žižytė

Tyrimų 2008–2012 m. tema:
„Laukinių ir kultūrinių augalų virusų ir fitoplazmų epidemiologiniai tyrimai bei genomų lyginamoji analizė“ (vadovas habil. dr. Juozas Staniulis).

Kiti moksliniai projektai

Pramoninės biotechnologijos plėtros programos projektai:

1. „Viroidų ir fitoplazmų detekcija ir pašalinimas iš biotechnologinei pramonei vertingų augalų“ (FITOVIROIDAI). Projekto trukmė 2007-2009 m. Projekto vadovas dr. R.Abraitis (Biotechnologijos institutas). Sutartis su Biotechnologijos institutu Nr. 17/08. Botanikos instituto atsakingas vykdytojas R.Jomantienė.
2. „Metagenominiai Lietuvos karštų požeminių vandenų ekstremofilų virusų tyrimai naujų fermentų paieškai“. Projekto trukmė 2007 m. gegužės mėn. – 2009 m. gruodžio mėn. Reg. Nr. 07005. Sutarties su Fondu Nr. N-08/2007. Projekto vadovas dr. Alma Gedvilaitė (Biotechnologijos inst.). Botanikos instituto atsakingas vykdytojas J. Staniulis.

Mokslinių tyrimų projektai, vykdomi pagal Aukštųjų technologijų plėtros programą:

1.,,Humanizuotų mielių raiškos sistemos kūrimas, panaudojant proteomikos ir genų inžinerijos metodus“. Projekto trukmė 2008 m. gegužės mėn. – 2010 m . gruodžio mėn. Registracijos Nr. B-08003. Projekto vadovas – Prof. Kęstutis Sasnauskas (Biotechnologijos inst.). Fondo sutarties su IBT Nr. B-36. BTI sutarties su BI Nr. B-36/2008-19/08. Atsakingas Botanikos instituto vykdytojas J.Staniulis.
2. „Rinovirusų vaidmens alerginių ligų patogenezėje tyrimai ir diagnostika“. LVMSF sutarties su Biotechnologijos institutu Nr. B-37/2008. Projekto trukmė 2008 m. gegužės mėn. – 2010 m. gruodžio mėn. Registracijos Nr. B-08003. Projekto pagrindinis vykdytojas: VU MF Vaikų ligų klinika, vadovė dr. Regina Ėmužytė. VU sutarties su Botanikos institutu Nr. B-37/2008-1. Atsakingas Botanikos instituto vykdytojas R.Jomantienė.

Darbai, vykdomi pagal tarptautinę mokslinę programą „Lietuvos–Ukrainos dvišalio bendradarbiavimo mokslinių tyrimų srityje programa“:

1. Projektas „Slyvų raupų viruso paplitimo Lietuvoje ir Ukrainoje tyrimas ir biotechnologinių metodų ruošimas bevirusinei sodinamajai medžiagai gauti“. Projekto partneriai – Botanikos institutas (Lietuva) ir Nacionalinis T.Ševčenkos Kijevo universitetas (Ukraina). Projekto vykdyme dalyvauja Botanikos instituto Fitovirusų laboratorija ir Kijevo universiteto Virusologijos katedros darbuotojai. Projekto trukmė 2007-2008 m. Projektą iš Lietuvos pusės finansavo Lietuvos ŠMM (Sutartis ŠMM – BI Nr. SUT-268) ir LVMSF (Sutartis Nr. V-12/2008, registracijos Nr. V-08013) iš Ukrainos pusės - Ukrainos švietimo ir mokslo ministerija. Projekto atsakingas vykdytojas J.Staniulis.
2. Projektas „Dekoratyvinius augalus pažeidžiančių virusų monitoringas ir apibūdinimas Lietuvoje ir Ukrainoje“. 2008 m. LVMSF sutartis V-14/2008. Projekto vadovas M. Navalinskienė. 

Fitovirusų laboratorija dalyvauja Europos Komisijos FP6 programos projekte “Co-ordination of Research on Genetic Resistance to Plant Pathogenic Viruses, and their Vectors, in European Crops” (“ResistVir”) Contract no.: FOOD-CT-2005-514048. Projekto trukmė 2005 02-2009 02. Projekto partneriai 49 institucijos iš 26 šalių. Projekto koordinatorius INRA, Prancūzija. Projekto lėšos – 2 274 199 EU. J.Staniulis yra atsakingas Botanikos instituto vykdytojas. Apie konsorciumo dalyvius galima rasti: http://www.resistvir.org/

Fitovirusų laboratorija dalyvauja tarptautiniame projekte „Enhanced control of Potato mop-top virus in the Nordic and Baltic Sea region“. Dalyvauja: Suomijos, Švedijos, Norvegijos, Danijos, Vokietijos Lenkijos, Lietuvos, Latvijos, Estijos, Rusijos mokslo institucijos. Koordinuoja Helsinkio universitetas (prof. Jari Valkonen). Lietuvai atstovauja 4 institucijos (VAAT, LMI, VSGKT ir Botanikos institutas). Projekto trukmė 2005-2009 vasario mėn. Projektas yra vykdomas, nors oficialių jo įforminimo dokumentų nėra pateikiama. Botanikos institutui projekte atstovauja J.Staniulis. Apie Botanikos instituto dalyvavimą projekte galima rasti: http://honeybee.helsinki.fi/mmsbl/Kpat/ryhmat/moptop/people.htm

Fitovirusų laboratorijos fitoplazmininkų grupė turi sutartį su USDA Beltsvilio mokslinių tyrimų centro Molekulinės augalų patologijos laboratorija, USDA-ARS, JAV: Specific Cooperative Agreement 58-1275-6-F142. „Genome based markers for detecting plant pathogenic phytoplasmas“. Botanikos instituto atsakinga vykdytoja dr. Rasa Jomantienė.

Bendradarbiavimas su užsienio partneriais:
http://www.barc.usda.gov/psi/mppl/spiroplasma/page2.html
 

Publikacijos

Knygos

Navalinskienė M., Samuitienė M., 2006: Dekoratyvinių augalų virusinės ligos ir jų sukėlėjai Lietuvoje. – Kaunas, 258 p. Lututė,

Straipsniai

2009
Stanienė G., Stanys V., Vinskienė J., Abraitis R., [Jomantienė R., Valiūnas D.,] Abraitienė A. 2009: Fitoplazmomis ir viroidais infekuotos trešnės (Prunus avium L.) in vitro kultūra. – Žemdirbystė-Agriculture, 96(3): 129-140.  ISSN 1392-3196. 

[Navalinskienė M., Samuitienė M.], Koroteyeva A., Polischuk V. 2008: Detection and identification of viruses affecting orchids in Lithuania and Ukraine. – Botanica Lithuanica, ISSN 1392-1665, Botanikos institutas, 14(3): 191–198.

[Samuitienė M., Navalinskienė M.], 2009: The agents associated with viral and phytoplasmal diseases affecting rudbeckias (Rudbeckia L.) – Botanica Lithuanica, ISSN 1392-1665, Botanikos institutas, 15(1): 53–59.

[Zitikaitė I., Staniulis J.] 2009: Izolation and characterization of tobacco necrosis virus detected on some vegetable species. –  Biologija, ISSN 1392-0146, Lietuvos mokslų akademijos leidykla ,  55(1): 35-39.

Urbanavičienė L., 2008: Infection of Barley yellow dwarf virus in wheat (Triticum aestivum)  –  Botanica Lithuanica, ISSN 1392–1665, Botanikos institutas, 14 (4): 241–245.

[Valiunas D., Jomantiene R.,] Davis R. E., 2009: Establishment of a new phytoplasma subgroup, 16SrI-Q, to accomodate a previously undescribed phytoplasma found in diseased cherry in Lithuania. – Journal of Plant Pathology, 91(1): 71-75.  http://www.sipav.org/main/jpp/jol.htm  ISSN: 1125-4653.

[Valiunas D., Jomantiene R., Ivanauskas A.,] Abraitis R., Staniene G., Zhao Y., Davis R. E., 2009: First Report of a New Phytoplasma Subgroup, 16SrIII-T, Associated with Decline Disease Affecting Sweet and Sour Cherry Trees in Lithuania.  Plant Disease, 93(5): 550.  http://apsjournals.apsnet.org/loi/pdis?cookieSet=1  ISSN: 0191-2917.

[Samuitiene, M., Navalinskiene, M.], Eid, S. G., and Pappu, H. R. 2009: Dahlia mosaic–associated caulimoviruses in dahlia in Lithuania. – Online. Plant Health Progress doi, ISSN 1535–1025: 10.1094/PHP-2009-0302-01-BR, Plant Management Network.

Adams I. P., Glover R.H., Monger W. A., Mumford R., Jackeviciene E., [Navalinskiene M., Samuitiene M.] and Boonham N., 2009: Next-generation sequencing and metagenomic analysis: a universal diagnostic tool in plant virology. – Molecular Plant Pathology., Central Science Laboratory Journal Compillation, Blackwell Publishing LTD, Doi: 10.111/J. 1364-3703.2009.00545: 1–9.

2008
BOGOUTDINOV D. Z., VALIŪNAS D., NAVALINSKIENĖ M., SAMUITIENĖ M., 2008: O vidovoj identifikacii vozbuditelej fitoplazmozov paslennyh. – Sel‘skohoz. Biologija, 1: 77–80.
JUODKAITĖ R., BALIŪNIENĖ A., NAUJALIS J. R., NAVALINSKIENĖ M., SAMUITIENĖ M., 2008: Selection and presentation of tulip (Tulipa L.) cultivars to Lithuanian Plant Genetic Resources. – Biologija, 54 (2): 139–146.
JUOZAPAITIS M., ZVIRBLIENĖ A., KUCINSKAITE I., SEZAITE I., SLIBINSKAS R., MAYTE COIRAS, FERNANDO DE ORY MANCHON, MARIA ROSA LOPEZ-HUERTAS, PILAR PEREZ-BRENA, STANIULIS J., NARKEVICIUTE I., SASNAUSKAS K. 2008: Synthesis of recombinant human parainfluenza virus 1 and 3 nucleocapsid proteins in yeast Saccharomyces cerevisiae. – Virus Research, 133: 178–186.
NAVALINSKIENĖ M. SAMUITIENĖ M., 2008:. Identifikacija virusov, poražajuščih tradeskancii gruppy Andersona [Tradescantia (Andersoniana)]. – Materialy Sed‘moj meždunarodnoj naučno-praktičeskoj konferencijii „Problemy botaniki Južnoj Sibiri i Mongolii“,21–24 oktjabrja 2008 g. Barnaul, Altaijskij gosuniversitet: 204–209.
NAVALINSKIENĖ M., SAMUITIENĖ M. 2008: Natural infection of Alfalfa mosaic alfamovirus in Petunia hybrida Vilm. – Botanica Lithuanica, 14(1): 57–63.
NAVALINSKIENĖ M., SAMUITIENĖ M., LOSINSKA R., 2008: Poraženie floksov virusami i fitoplazmoj v Litve. – Biull. Gl. Bot. Sada, 194: 187–193.
NAVALINSKIENĖ M., SAMUITIENĖ M., 2008: Rasprostranenie virusnykh boleznej pri introdukcii dekorativnykh rastenij –„Aktual‘nye problemy botaniki v Armenii“ 6–9 oktjabrja 2008 g., Erevan, Institut botaniki NAN RA: 386–390.
NORKUS T., STANIULIS J., ŽIŽYTĖ M., MELNYK M., YUSKO L., SNIHUR H., BUDZANIVSKA I., POLISCHUK V. 2008: Molecular identification of plum pox virus isolates from Lithuania and Ukraine . – Zemdirbyste-Agriculture, 95(3):. 277–285.
SAMUITIENĖ M., NAVALINSKIENĖ M. 2008: Burbulius (Trollius L.) pažeidžiantys virusai ir fitoplazmos. – Lietuvos biologinė įvairovė. Būklė, struktūra, apsauga. Mokslinių straipsnių rinkinys, 3: 108–114.
SAMUITIENĖ M., NAVALINSKIENĖ M. 2008: Iridaceae Juss. šeimos dekoratyvinių augalų virusinės ligos Lietuvos gėlynuose. – Miestų želdynų formavimas‘2008: gėlės ir gėlynai. Mokslinių straipsnių rinkinys, 91: 131–134.
SAMUITIENĖ M., NAVALINSKIENĖ M. 2008: Occurence of Cucumber mosaic cucumovirus on ornamental plants in Lithuania. – Žemdirbystė–Agriculture, 95: 135–143.
SAMUITIENĖ M., NAVALINSKIENĖ M., 2008: Identification of viral and phytoplasmal agents responsible for diseases affecting plamts of Thalictrum L. in Lithuania. – Vytauto Didžiojo universiteto botanikos sodo raštai / Scripta Horti Botanici Universitatis Vytauti Magni, 12: 59-72.
SAMUITIENĖ M., NAVALINSKIENĖ M., Bogoutdinov D., 2008: Fitoplazmos – dekoratyvinių augalų ligų sukėlėjos. – Jaunųjų mokslininkų darbai. Journal of Young Scientists: 3(19): 118–124.
SAMUITIENĖ M., NAVALINSKIENĖ M., JACKEVIČIENĖ E., 2008: Arabis mosaic nepovirus on ornamental plants. – Biologija, 54 (4): 264–268.
STANIULIS J., ŽIŽYTĖ M., NORKUS T., YUSKO L., SNIHUR H., BUDZANIVSKA I. 2008: Incidence of plum pox virus in Lithuania and Ukraine. Visnik Kiivskogo Nacional‘nogo Universitetu įmeni Tarasa Shevchenki, Biologija, 51: 50–54.
URBANAVIČIENĖ L. 2008: Identification of ryegrass mosaic rymovirus in Poaceae plants. – Biologija, 54 : 75–78.
URBANAVIČIENĖ L. 2008: Miežių geltonosios žemaūgės viruso infekcija kukurūzuose (Zea mays L.). – Lietuvos biologinė įvairovė (būklė, struktūra, apsauga). Mokslinių straipsnių rinkinys, 3: 115–120.
URBANAVIČIENĖ L., VALIŪNAS D., JOMANTIENĖ R. 2008: Molecular identification of agents causing yellows diseases in oats (Avena sativa L.). – Žemdirbystė–Agriculture, 95 (3): 286–292.
VALIŪNAS D., SAMUITIENĖ M., NAVALINSKIENĖ M., DAVIS R.E., 2008: Identification of viral and phytoplasmal agents responsible for diseases affecting plants of Gaillardia Foug. in Lithuania. – Agronomy Research, 6(1): 109-118.
WEI W., R.E.DAVIS, R. JOMANTIENĖ, Y.ZHAO., 2008: Ancient, recurrent phage attacks and recombination shaped dynamic sequence-variable mosaics at the root of phytoplasma genome evolution.– Proc Natl Acad Sci USA, 105(33): 11827–11832.
ZITIKAITĖ I. 2008. Nematode-transmissible virus disease agents detected in some vegetable crops. – Vytauto Didžiojo universiteto botanikos sodo raštai / Scripta Horti Botanici Universitatis Vytauti Magni, 12: 147-163.
ZITIKAITĖ I., 2008: Morkas pažeidžiantys virusai Lietuvoje ir jų diagnostika. – Jaunųjų mokslininkų darbai / Journal of Young Scientists,3(19): 154–157.
ZITIKAITĖ I., NAVALINSKIENĖ M. 2008: Daržovinių rabarbatų žiediškosios dėmėtligės sukėlėjo identifikavimas – Lietuvos biologinė įvairovė. Būklė, struktūra, apsauga. Mokslo straipsnių rinkiniai, MSR serija, 3: 121-127.
ZITIKAITĖ I., SAMUITIENĖ M. 2008: Identification and some properties of Alfalfa mosaic alfamovirus isolated from naturally infected tomato crop. – Biologija, 54(2): 83-88.

2007
Jomantiene R., Davis, R.E. 2007: Repeated conserved sequences as genetic markers for phytoplasma detection. – Bulletin of Insectology, 60(2): 259-260.
Jomantiene R., Zhao Y., Davis R.E., 2007: Sequence-variable mosaics: composites of recurrent transposition characterizing the genomes of phylogenetically diverse phytoplasmas. - DNA Cell Biol., 26(8): 557-564.
Jomantiene R., Y. Zhao, Davis R. E., 2007: Phylogenetically diverse phytoplasmas are characterized by genes clustered in repeated sequence variable mosaics, facilitating genome plasticity. – Phytopathology, 97: S53.
Juozapaitis M., Serva A., Zvirbliene A., Slibinskas R., Staniulis J., Sasnauskas K., Shiell B.J., Wang L-F., Michalski W.P., 2007: Generation of henipavirus nucleocapsid proteins in yeast Saccharomyces cerevisiae. – Virus Research, 124: 95-102.
Juozapaitis M., Serva A., Kucinskaite I., Zvirbliene A., Slibinskas R., Staniulis J., Sasnauskas K., Shiell B.J., Bowden T.R., Michalski W.P., 2007: Generation of menangle virus nucleocapsid-like particles in yeast Saccharomyces cerevisiae. - Journal of Biotechnology, 130: 441-447.
Kucinskaite I., Juozapaitis M., Serva A., Zvirbliene A., Johnson N., Staniulis J., Fooks A.R., Müller T., Sasnauskas K., Ulrich R.G., 2007: Antigenic characterisation of yeast-expressed lysavirus nucleoproteins. – Virus Genes, 35: 521-529.
Navalinskienė M, Samuitienė M., 2007: Kurpelių (Aconitum L.) virusinės ir fitoplazminės ligų sukėlėjai. – In: Lietuvos biologinė įvairovė: būklė, struktūra, apsauga, 2: 85–92.
Navalinskienė M., Samuitienė M., 2007: Porazhenie orchidej roda Cymbidium sw. Virusom pogremkovosti tabaka. – Vestnik Tverskogo gosudarstvennogo universiteta, Serija: biologija i ekologija, Vyp. 4, 8(36): 35–37.
Navalinskienė M, Samuitienė M., Pansevič A., 2007: Gencijonus pažeidžiantys virusai. – In: Jaunųjų mokslininkų darbai, 2(13): 112-118.
Samuitienė M., Jomantienė R., Valiūnas D., Navalinskienė M., Davis R. E., 2007: Phytoplasma strains detected in ornamental plants in Lithuania. - Bulletin of Insectology, 60 (2): 137-138.
Urbanaviciene L., Jomantiene R., Valiunas D., Davis R.E., 2007: Molecular identification of 16SrI-A, 16SrI-B, 16SrI-C, and 16SrI-L subgroups of phytoplasmas in gramineous plants in Lithuania. – Bulletin of Insectology, 60(2): 127-128.
Urbanavičienė L., Jomantienė R., Valiūnas D., Jaciunskas K., 2007: Varpinius augalus pažeidžiančių fitoplazmų identifikavimas ir klasifikacija. – In: Lietuvos biologinė įvairovė: būklė, struktūra, apsauga, 2: 112-118.
Valiunas D., Jomantiene R., Davis R.E., 2007: Phytoplasmas detected in cultivated fruit plants in Lithuania. – Bulletin of Insectology, 60(2): 139-140.
Valiunas D., M. Samuitiene, V. Rasomavicius, M. Navalinskiene, J. Staniulis, Davis R. E., 2007: Subgroup 16SrIII-F phytoplasma strains in an invasive plant Heracleum sosnowskyi, and an ornamental, Dictamnus albus. – J. of Plant Pathol., 89(1): 137–140.
Valiūnas D., Urbanavičienė L., Jomantienė R., Davis R.E., 2007: Molecular detection, classification and phylogenetic analysis of subgroup 16SrI-C phytoplasmas detected in diseased Poa and Festuca in Lithuania. – Biologija, 53 (2): 36–39.
ZITIKAITĖ I., JOMANTIENĖ R., STANIULIS J. 2007: Detection of natural infection of tomato crop by Potato X potexvirus. – Botanica Lithuanica, 13(3): 203-209.
Zitikaitė I., Karpavičienė B., 2007: Virusų įvairovė retose česnako (Allium L.) rūšyse Lietuvoje. – In: Lietuvos biologinė įvairovė: būklė, struktūra, apsauga, 2: 119-125.

2006
Bulavaitė A., Sabaliauskaitė R., Staniulis J., Sasnauskas K., 2006: Synthesis of hepatitis B virus surcace protein derivatives in yeast S. Cerevisiae. – Biologija, 4: 49-53.
Gedvilaite A., Dorn D.C., Sasnauskas K., Pecher G., Bulavaite A., Lawatscheck R., Staniulis J., Dalianis T., Ramqvist T., Schonrich G., Raftery M.J., Ulrich R., 2006: Virus-like particles derived from major capsid protein VP1 of different polyomaviruses differ in their ability to induce maturation in human dendritic cells. – Virology, 354: 252–260.
Gedvilaite A., Aleksaite E., Staniulis J., Ulrich R., Sasnauskas K., 2006: Size and position of truncations in the carboxy-terminal region of major capsid protein VP1 of hamster polyomavirus expressed in yeast determine its assembly capacity. – Archives of Virology, 151: 1811–1825.
Jomantiene r., davis r.e., 2006: Clusters of diverse genes existing as multiple, sequence variable mosaics in the phytoplasma genome. – FEMS Letters, 255(1):59-65.
Juozapaitis M., Coiras M., Staniulis J., Sasnauskas K., 2006: Synthesis of human respiratory syncytial virus nucleoprotein in yeast Saccharomyces cerevisiae. – Biologija, 3: 79-82.
Navalinskienė M., Samuitienė M., 2006: Poraženie virusami oranžerejnyh rastenij nekotoryh vidov semejstva arojdnyh (Araceae Juss.). – Vagos, 69(22): 50–55.
Navalinskienė M., Samuitienė M., 2006: Identification of agents associated with viral and phytoplasmal diseases in common hyacinth (Hyacinthus orientalis L.) – Biologija, 2: 54–58.
Navalinskienė M., Samuitienė M., 2006: Identification of viruses infecting primroses (Primula L.) and virological evaluation of the Lithuanian hybrids. – Scripta Horti Botanici Universitatis Vytauti Magn, 11: 58–65.
Navalinskene M., Samuitene M., Šriubėnene J., 2006:  Identifikacija virusov, poražajuščih lilejnik v kollekcijah Litvy. – Biologičeskij vestnik , 10(2): 84–88.
Navalinskienė M., M. Samuitienė, I. Zitikaitė, 2006: Nepovirus and phytoplasma detected in sneezeweed (Helenium L.) ornamental species. – Botanica Lithuanica, 12(4): 253–257.
Samuitienė M., Navalinskienė M., 2006: Identification of viruses and phytoplasma infecting scarlet lychnis (Lychnis chalcedonica L.) plants. – Biologija, 2: 59–62.
Samuitienė M., Navalinskienė M., 2006: Molecular detection and characterization of phytoplasma infecting Celosia argentea L. plants in Lithuania. – Agronomy Research, 4: 345-348.
Samuitiene M., Navalinskiene M., Davis R.E., Jomantiene R., 2006: Molecular characterization of diverse phytoplasmas of subgroups 16SrI-A, 16SrI-B, 16SrI-L, and 16SrI-M infecting ornamental plants in Lithuania. – Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 1: 47-51.
Shao j., Jomantiene r, Dally e.l., Zhao y.,Lee i-m., Nuss d.l., Davis r.e., 2006: Phylogeny and characterization of phytoplasmal NusA and use of the nusA gene in detection of group 16SrI strains. – J. Plant Pathology, 88: 193-201.
Staniulis J., 2006: Plum pox virus (PPV) in Lithuania. – OEPP/EPPO Bulletin, 36: 205.
Urbanavičienė L., Valiūnas D., 2006: Identification of aster yellows group (subgroup 16SrI-C) phytoplasma in Festuca arundinaceae Schreb. Based on PCR and RFLP methods. – Botanica Lithuanica, 12(2): 121–125.
Urbanavičienė L., Valiūnas D., Jomantienė R., 2006: Detection of aster yellows group (subgroup 16SrI-B phytoplasma in oats based on nested PCR and RFLP in Lithuania. – Agronomy research, 4: 417–420.
Valiunas D., Staniulis J., Davis R. 2006: ‘Candidatus Phytoplasma fragariae’, a new phytoplasma taxon discovered in yellows diseased strawberry, Fragaria x ananassa. – Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 56: 277-281.
Vasinauskienė M., Radušienė J., Zitikaitė I., Survilienė E., 2006: Antibacterial activities of essential oils from aromatic and medicinal plants against growth of phytopathogenic bacteria. – Agronomy Research, 4: 437-440.
Zitikaitė I., J. Staniulis. 2006: The use RT-PCR for detection of cucumber infecting viruses. – Agronomy Research, 4: 471-474.
Zitikaitė I., E. Survilienė, G. Būtaitė. 2006: Pomidorų (Lycopersicon esculentum Mill.) virusų diagnostika elektronomikroskopiniu ir molekuliniu metodais. – Sodininkystė ir daržininkystė. Mokslo darbai, 25(4): 230–239.
Zitikaitė I., E. Survilienė, Z. Jančys. 2006: Detection and characterization of a new nepovirus isolated from Lycopersicon esculentum Mill. crop in Lithuania.– Biologija (Vilnius), 2: 63-67.
Žižytė M., J. Staniulis, Zitikaitė I., 2006: Identification of Beet necrotic yellow vein virus isolate detected in Lithuania.  Agronomy Research, 4: 475-478.

2005
Davis R. E., Dally E. L., Jomantiene R., Zhao Y., Roe B., Lin S., Shao J., 2005: Cryptic plasmid pSKU146 from the wall-less plant pathogen Spiroplasma kunkelii encodes an adhesin and components of a type IV translocation-related conjugation system. – Plasmid. Mar; 53(2): 179-90.
Davis R. E., Jomantiene R., Zhao Y., 2005: Lineage-specific decay of folate biosynthesis genes suggests ongoing host adaptation in phytoplasmas. – DNA Cell Biol. Dec; 24(12): 832-40.
Davis R.E., Dally E. L., Jomantiene R., Zhao Y., Roe B., Lin S.P., Shao J., 2005: Cryptic plasmid pSKU146 from the wall-less plant pathogen Spiroplasma kunkelii encodes an adhesin and components of a type IV translocation-related conjugation system. – PLASMID, 53(2): 179-90.
Jomantiene r., davis r.e., 2005. Apple sessile leaf: a new disease associated with a “Candidatus Phytoplasma asteris” subgroup 16SrI-B phytoplasma in Lithuania. – Plant Pathology, 54: 237.
Juodkaitė R., Naujalis J., Navalinskienė M., Samuitienė M., 2005: Evaluation of tulip (Tulipa L.) decorative capacities and resistance to Tulip breaking potyvirus (TBV) in the tulip collection of the Botanical Garden of Vilnius University – Biologija, 4: 64–70.
Juozapaitis M., Slibinskas R., Staniulis J., Sakaguchi T., Sasnauskas K. 2005: Generation of Sendai virus nucleocapsid-like particles in yeast. – Virus Research, 108: 221-224.
Navalinskienė M., Raugalas J., Samuitienė M., 2005: Viral diseases of flower plants 16. Identification of viruses affecting orchids (Cymbidium Sw.) – Biologija, 2: 29-34.
Navalinskienė M., Samuitienė M, Jomantienė R., 2005: Molecular detection and characterisation of phytoplasma infecting Callistephus chinensis (L.) Nees. plants in Lithuania. – Phytopathol. Polonica, 35: 109-112.
Navalinskienė M., Samuitienė M., 2005: Virusologičeskaja ocenka predstavitelej roda Hosta v kollekcijah botaničeskih sadov Litvy. – Biull. Glavn. Bot. Sada, 189: 273–280.
Staniulis J., 2005: Preliminary investigation on detection of strawberry and raspberry virus disease agents in Lithuania. – Phytopathologia Polonica, 35: 147-150.
Urbanavičienė L., 2005. Molecular detection and identification of phytoplasma affecting smooth bromegrass (Bromopsis inermis (Leyss.) Holub). – Botanica Lithuanica, 11(3):191-194.
Urbanavičienė L., Jomantienė R., Davis R. E., 2005: First report of barley as host of a phytoplasma belonging to group 16SrI, subgroup B, and ribosomal protein subgroup rpI-B in Lithuania. – Plant Disease, 89: 339.
Urbanavičienė L., Valiūnas D., Jomantienė R., 2005: Molecular detection and identification of subgroup 16SrI-L phytoplasma in ryegrass (Lolium multiflorum). – Phytopathologia Polonica, 35:121-124.
Zitikaite I., Staniulis J., Navalinskiene M., Kaseta V., 2005: Detection of Tobacco necrosis virus (TNV) in Phaseolus vulgaris plants. – Phytopathologia Polonica, 35: 141-145.
Zitikaitė I., Staniulis J., Vasinauskienė M., 2005: Biological and molecular identification of Tobacco necrosis necrovirus in cucumber crop in Lithuania. Scientific works of the Lithuanian Institute of Horticulture and Lithuanian University of Agriculture. – Horticulture and Vegetable Growing, 24(3): 352-361.

2004
Dapkūnienė S., Indrišiūnaitė G., Juodkaitė R., Navalinskienė M., Samuitienė M., 2004: Viruses affecting lilies and their elimination by tissue culture. – Sodininkystė ir daržininkystė. Mokslo darbai, 23(2): 182-191.
Dapkūnienė S., Indrišiūnaitė G., Juodkaitė R., Navalinskienė M., Samuitienė M., 2004: Elimination of lily viruses depending on explant. – Acta Universitatis Latviensis, Biology, 676: 163-166.
Navalinskienė M., Samuitienė M., 2004: Identification of Tobacco mosaic tobamovirus and 16SrI-M phytoplasma subgroup in Phlox drummondii Hook. plants. – Botanica Lithuanica, 10(3): 223-231.
Navalinskienė M., Samuitienė M., 2004: Virological evaluation of the Lithuanian dahlia (Dahlia Cav.), gladiolus (Gladiolus L.), iris (Iris L.) and peony (Paeonia L.) cultivars and hybrids. – Biologija, 3: 57-63.
Navalinskienė M., Samuitienė M., Jomantienė R., 2004: Identification of viruses and phytoplasma infecting delphinium (Delphinium L.) plants in Lithuania. – Agronomijas Vestis. Latvian Journal of Agronomy (Jelgava), 7: 60-66.
Navalinskienė M., Samuitienė M., Jomantienė R., 2003: Identification of ToRSV and 16SrI-A subgroup of phytoplasmas infecting hellebore plants in Lithuania. – Sodininkystė ir daržininkystė. Mokslo darbai, 22(3): 259-268.
Rabenstein F., Urbanavičienė L., Staniulis J., 2004: Festuca necrosis. – In: Lapierre H., Signoret P.-A. (eds.). Viruses and virus diseases of Poaceae (Gramineae). INRA, Paris.: 762-763.
Samuitienė M., Navalinskienė M., Jomantienė R., Davis R.E., 2004: Molecular detection and characterization of phytoplasmas infecting columbine (Aquilegia L.) plants. – Biologija, 2(suppl. 1): 15-17.
Samuitienė M., Navalinskienė M., Staniulis J., Petniūnas P., 2004: Identification of Tobacco rattle tobravirus in ornamental plants by RT-PCR and immunosorbent electron microscopy. – Botanica Lithuanica, 10(1): 81-88.
Slibinskas R., Samuel D., Gedvilaite A., Staniulis J., Sasnauskas K. 2004: Synthesis of the measles virus nucleoprotein in yeast Pichia pastoris and Saccharomyces cerevisiae. – J. Biotechnology, 107: 115-124.
Staniulis J., Zitikaitė I., Žvirblienė A., Kašėta V., 2004: Identification of Tobacco necrosis virus from strawberry in Lithuania. – Agronomijas Vestis. Latvian Journal of Agronomy, 7: 49-54.
Urbanavičienė L., 2004: Viral diseases of Poaceae family plants. – Žemės ūkio mokslai (Vilnius), 1: 19-23.
Urbanavičienė L., Jackevičienė E., 2004: Identification and some properties of Barley yellow dwarf luteovirus in Lithuania – Agronomijas vestis. Latvian journal of agronomy (Jelgava), 7: 67- 71.
Urbanavičienė L., Jomantienė R., Valiūnas D., Davis R. E., 2004: Molecular detection of phytoplasmas in oats, barley, and Triticosecale and their classification based on 16S rRNA gene polymorphisms. – Žemės ūkio mokslai (Vilnius), 3: 15-19.
Urbanaviciene L., Jomantiene R., Davis R.E., 2004: First report of barley as host of  a phytoplasma belonging to group 16SrI, subgroup B, and ribosomal protein subgroup rpI-B in Lithuania. – Plant Disease, 89: 339.
Valiunas D., Alminaite A., Jomantiene R., Davis R. E., Maas, J. L., 2004: Possible cause of European blueberry disease is related to North American milkweed yellows phytoplasma. – J. Plant Pathology, 86: 135-140.
Valiūnas D., Jomantienė R., Davis R. E., 2004: Identification of subgroup 16SrI-B phytoplasma  from naturally infected pear in Lithuania. – Sodininkystė ir daržininkystė, mokslo darbai, 23(4): 29-36.
Zhao Y., Wang H., Hammond R. W., Jomantiene R., Liu Q., Lin S., Roe B. A., Davis R. E., 2004: Predicted ATP-binding cassette systems in the phytopathogenic mollicute Spiroplasma kunkelii. – Mol Genet Genomics, 271(3): 325-328.
Zitikaitė I., Staniulis J., Jackevičienė E., 2004: Detection of injurious viruses in tomatoes. – Agronomijas Vestis. Latvian Journal of Agronomy, 7: 55-59.
Zitikaitė I., Staniulis J., Jomantienė R., Petniūnas P., 2004: Molecular and immunoelectron microscopic identification of Pepino mosaic potexvirus in tomato fruits imported from Spain. – Botanica Lithuanica, 10(1): 89-98.

Genų banko duomenų bazėje (Genbank Database) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide)
paskelbtos rDNR nukleotidinės sekos:

Alminaite A., Davis R.E., Valiunas D., Jomantiene R., Epilobium phyllody phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, partial sequence; 16S-23S intergenic spacer and tRNA-Ile gene, complete sequence and 23S ribosomal RNA gene, partial sequence,  acc. no. AY101386.
Jomantiene R., Davis R. E., Antoniuk L., Staniulis J., Alfalfa stunt phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, acc. no. AF177384.
Jomantiene R., Davis R. E., Cirsium white leaf phytoplasma ribosomal RNA operon B, acc. no. AF373106.
Jomantiene R., Davis R. E., Cirsium white leaf phytoplasma ribosomal RNA operon A, acc. no. AF373105.
Jomantiene R., Davis R. E., dandelion virescence phytoplasma ribosomal RNA operon B, acc. no. AF370120.
Jomantiene R., Davis R. E., Dandelion virescence phytoplasma ribosomal RNA operon A, acc. no. AF370119.
Jomantiene R., Davis R. E., Valiunas D., Staniulis J. B., Alminaite A., Gaillardia phylody phytoplasma, 16S ribosomal RNA gene, partial sequence; tRNA-Ile gene, complete sequence; and 23S ribosomal RNA gene, partial sequence,, acc. no. AY049029.
Jomantiene R., Davis R.E., Alminaite A., Valiunas D., Jasinskaite R., Oat proliferation phytoplasma ribosomal RNA operon, partial sequence, acc. no. AF453416.
Jomantiene R., Davis R.E., Antoniuk L., Staniulis J., Soybean veinal necrosis phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, acc. no. AF177383.
Jomantiene R., Staniulis J., Antoniuk L., Davis R. E., Cirsium yellows phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, acc. no. AF200431.
Kuisiene N., Jomantiene R., Valiunas D., Chitavichius D., Geobacillus lituanicus 16S ribosomal RNA gene, acc. no. AY044055.
Kuisiene N., Jomantiene R., Valiunas D., Chitavichius D., Geobacillus stearothermophilus strain 28 16S ribosomal RNA gene, acc. no. AY044054.
Kuisiene N., Jomantiene R., Valiunas D., Chitavichius D., Geobacillus stearothermophilus strain 3 16S ribosomal RNA gene, acc. no. AY 044052.
Kuisiene N., Jomantiene R., Valiunas D., Chitavichius D., Geobacillus stearothermophilus strain 32A 16S ribosomal RNA gene, acc. no. AY044053.
Staniulis J. B., Davis R. E., Jomantiene R., Kalvelyte A., Dally E. L., Clover yellow edge phytoplasma ribosomal RNA operon, acc. no. AF175304.
Valiunas D., Alminaite A., Davis R. E., Staniulis J., Jomantiene R., Alder yellows phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, partial sequence, acc. no. AY028789.
Valiunas D., Davis R. E., Jomantiene R., Blueberry proliferation phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, partial sequence; tRNA-Ile gene, complete sequence; and 23S ribosomal RNA gene, partial sequence,, acc. no. AY034090.
Valiunas D., Davis R. E., Jomantiene R., Cherry little leaf phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, partial sequence, acc. no. AY034089.
Valiunas D., Davis R. E., Jomantiene R., Valeriana yellows phytoplasma clone ValY1 rrnB operon, partial sequence, acc. no. AY102273.
Valiunas D., Davis R. E., Jomantiene R., Valeriana yellows phytoplasma clone ValY2 rrnA operon, partial sequence, acc. no. AY102274.
Valiunas D., Davis R. E., Maas J. L., Alminaite A., Jomantiene R., Aconitum proliferation phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, partial sequence; tRNA-Ile gene, complete sequence; and 23S ribosomal RNA gene, partial sequence, acc. no. AF510323.
Valiunas D., Jomantiene R., Davis R. E., Carrot proliferation phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, partial sequence, acc.no. AF291682.
Valiunas D., Samuitiene,M., Rasomavicius,V., Staniulis, J., Davis, R.E. Heracleum yellows phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, partial sequence; 16S-23S ribosomal RNA intergenic spacer and tRNA-Ile gene, complete sequence; and 23S ribosomal RNA gene, partial sequence. acc. no. DQ164213.
Valiunas D., Urbanaviciene,L., Jomantiene,R., Davis,R.E. Festuca yellows phytoplasma rrnB operon 16S ribosomal RNA gene, partial sequence.  acc. no. DQ640504.
Valiunas D., Urbanaviciene, L., Jomantiene, R., Davis,R.E. Festuca yellows phytoplasma rrnA operon 16S ribosomal RNA gene, partial sequence.  acc. no. DQ640503.
Valiunas D., Urbanaviciene,L., Jomantiene,R., Davis,R.E. Poa stunt phytoplasma rrnB operon 16S ribosomal RNA gene, partial sequence; 16S-23S ribosomal RNA intergenic spacer and tRNA-Ile gene, complete sequence; and 23S ribosomal RNA gene, partial sequence.  acc. no. DQ640502.
Valiunas D., Urbanaviciene,L., Jomantiene,R., Davis,R.E. Poa stunt phytoplasma rrnA operon 16S ribosomal RNA gene, partial sequence; and 16S-23S ribosomal RNA intergenic spacer, tRNA-Ile and 23S ribosomal RNA genes, complete sequence.  acc. no. DQ640501. 

Disertacijos

VALIŪNAS, D., 2003: Lietuvoje paplitusių fitoplazmų identifikavimas ir jų įvairovės bei molekulinių evoliucinių ryšių įvertinimas. – Daktaro disertacija (biomedicinos mokslai, biologija 01 B), apginta 2003-03-27 Botanikos institute. – Vad. dr. R. Jomantienė.